Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 NUDT4-204ENST00000547014 1419 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 E2F4-203ENST00000563238 736 ntTSL 210.25□□□□□ -0.778e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 CKS1B-206ENST00000474215 739 ntTSL 39.85□□□□□ -0.833e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 PRMT2-211ENST00000481861 1301 ntTSL 1 (best)9.77□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-234ENST00000552645 1623 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.851e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 GGCX-209ENST00000482662 720 ntTSL 39.67□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SNHG3-201ENST00000413987 2201 ntTSL 1 (best)9.63□□□□□ -0.871e-13■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RBM5-208ENST00000441305 569 ntTSL 39.6□□□□□ -0.875e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RBM4-210ENST00000528039 764 ntTSL 39.51□□□□□ -0.895e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.91e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 COPA-205ENST00000541366 616 ntTSL 29.42□□□□□ -0.98e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.943e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 EPS8L3-210ENST00000498743 449 ntTSL 29.15□□□□□ -0.943e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 COG1-209ENST00000582973 438 ntTSL 39.1□□□□□ -0.958e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SLC5A6-212ENST00000461319 598 ntTSL 38.97□□□□□ -0.974e-17■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 BABAM1-209ENST00000598382 424 ntTSL 28.93□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 AKT2-223ENST00000491778 573 ntTSL 48.4□□□□□ -1.068e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 THOC2-207ENST00000438358 1137 ntTSL 58.31□□□□□ -1.083e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 COQ9-211ENST00000567384 460 ntTSL 28.2□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 GLYR1-213ENST00000591846 389 ntTSL 38.13□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RBM5-205ENST00000433556 567 ntTSL 47.87□□□□□ -1.155e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-217ENST00000548516 850 ntTSL 57.8□□□□□ -1.161e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-228ENST00000550929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.161e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.185e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 27.5□□□□□ -1.213e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 CDC25C-208ENST00000514017 774 ntTSL 57.42□□□□□ -1.223e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 ZFC3H1-205ENST00000547398 470 ntTSL 27.3□□□□□ -1.241e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-214ENST00000548251 582 ntTSL 37.07□□□□□ -1.281e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SPG11-205ENST00000558080 759 ntTSL 1 (best)6.95□□□□□ -1.33e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-225ENST00000550715 907 ntTSL 26.83□□□□□ -1.321e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 PTCD3-205ENST00000464541 890 ntTSL 56.74□□□□□ -1.331e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 ACAD11-203ENST00000477604 740 ntTSL 36.72□□□□□ -1.333e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SAFB2-207ENST00000591101 551 ntTSL 26.55□□□□□ -1.365e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 ACAD11-210ENST00000510100 695 ntTSL 36.38□□□□□ -1.393e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 COPA-206ENST00000545266 574 ntTSL 26.35□□□□□ -1.398e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 CKS1B-204ENST00000471245 1166 ntTSL 1 (best)6.3□□□□□ -1.43e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 ACAD11-208ENST00000496418 3684 ntTSL 26.21□□□□□ -1.413e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 CKS1B-205ENST00000473344 390 ntTSL 36.21□□□□□ -1.423e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 ABCC2-203ENST00000496621 525 ntTSL 26.2□□□□□ -1.428e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 GLS-211ENST00000469774 557 ntTSL 35.88□□□□□ -1.473e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-226ENST00000550755 552 ntTSL 45.88□□□□□ -1.471e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 ZFC3H1-209ENST00000550963 845 ntTSL 55.74□□□□□ -1.491e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 UBAP2L-213ENST00000466173 804 ntTSL 25.68□□□□□ -1.51e-13■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 PTCD3-211ENST00000476215 754 ntTSL 35.64□□□□□ -1.511e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 COPA-207ENST00000545284 879 ntTSL 25.58□□□□□ -1.525e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-211ENST00000547660 601 ntTSL 45.53□□□□□ -1.521e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 BAG6-238ENST00000422948 513 ntTSL 25.41□□□□□ -1.543e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 COG1-206ENST00000582512 506 ntTSL 25.35□□□□□ -1.558e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SRP72-203ENST00000505314 1071 ntTSL 35.3□□□□□ -1.563e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RBM5-204ENST00000417905 427 ntTSL 55.23□□□□□ -1.575e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SPG11-220ENST00000559933 518 ntTSL 25.09□□□□□ -1.593e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-207ENST00000547029 455 ntTSL 45.07□□□□□ -1.61e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-227ENST00000550814 565 ntTSL 45.07□□□□□ -1.61e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.613e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.623e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 TRMT11-206ENST00000466316 729 ntTSL 54.86□□□□□ -1.631e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 PRKAB2-203ENST00000496858 601 ntTSL 34.76□□□□□ -1.658e-15■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 PCM1-207ENST00000518762 546 ntTSL 44.68□□□□□ -1.663e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP7-205ENST00000562615 304 ntTSL 24.6□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 XPO5-204ENST00000424378 624 ntTSL 34.55□□□□□ -1.683e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 PCM1-223ENST00000524356 577 ntTSL 24.47□□□□□ -1.693e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-232ENST00000552430 608 ntTSL 34.44□□□□□ -1.71e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 HMGN1-218ENST00000490032 405 ntTSL 34.21□□□□□ -1.748e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 LETMD1-237ENST00000553175 555 ntTSL 43.85□□□□□ -1.791e-8■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 ACAD11-209ENST00000507705 568 ntTSL 43.83□□□□□ -1.83e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 CKS1B-207ENST00000477676 602 ntTSL 33.67□□□□□ -1.823e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 THOC2-212ENST00000464161 660 ntTSL 23.59□□□□□ -1.833e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 RPL7L1-206ENST00000487619 490 ntTSL 43.48□□□□□ -1.852e-12■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 XPO5-210ENST00000496341 800 ntTSL 52.82□□□□□ -1.963e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.973e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 UBE3A-212ENST00000626589 394 ntTSL 52.72□□□□□ -1.973e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP7-211ENST00000565883 453 ntTSL 22.42□□□□□ -2.023e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.083e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SNHG3-203ENST00000447507 185 ntTSL 1 (best)1.1□□□□□ -2.231e-13■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.164e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.044e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.224e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.263e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.533e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 STK36-216ENST00000492486 592 ntTSL 310.38□□□□□ -0.752e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 STK36-214ENST00000480709 652 ntTSL 46.76□□□□□ -1.332e-7■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP10-202ENST00000540269 3070 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.374e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP10-207ENST00000563048 1315 ntTSL 210.25□□□□□ -0.774e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP10-215ENST00000569038 730 ntTSL 37.49□□□□□ -1.214e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 USP10-218ENST00000570053 502 ntTSL 35.06□□□□□ -1.64e-6■□□□□ 9.9
SF3A3Q12874 HNRNPH1-228ENST00000515714 690 ntTSL 416.16■□□□□ 0.185e-9■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 HNRNPH1-208ENST00000503664 569 ntTSL 414.75□□□□□ -0.055e-9■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 HNRNPH1-219ENST00000512273 501 ntTSL 47.74□□□□□ -1.175e-9■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-227ENST00000462147 576 ntTSL 421.71■■□□□ 1.072e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-209ENST00000411484 561 ntTSL 418.71■□□□□ 0.592e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-217ENST00000436795 775 ntTSL 518.43■□□□□ 0.542e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-231ENST00000469175 486 ntTSL 317.88■□□□□ 0.452e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-218ENST00000437066 574 ntTSL 415.4■□□□□ 0.062e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-242ENST00000492978 775 ntTSL 314.85□□□□□ -0.032e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-235ENST00000475823 371 ntTSL 39.27□□□□□ -0.932e-8■□□□□ 9.8
SF3A3Q12874 SEPT2-224ENST00000457335 570 ntTSL 47.46□□□□□ -1.222e-8■□□□□ 9.8
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