Protein–RNA interactions for Protein: Q0P140

HSD52, Putative uncharacterized protein HSD52, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD52Q0P140 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 DDR1-238ENST00000446312 3202 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HSD52Q0P140 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 TMEM220-201ENST00000341871 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 DIAPH2-203ENST00000373049 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 TNRC6C-201ENST00000301624 9632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HSD52Q0P140 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms