Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABPAQ06546 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms