Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARID5AQ03989 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms