Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CACNA1BQ00975 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms