Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms