Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NOMO3P69849 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms