Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CLDN15P56746 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CLDN15P56746 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CLDN15P56746 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms