Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CENPFP49454 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPFP49454 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPFP49454 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CENPFP49454 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CENPFP49454 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CENPFP49454 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPFP49454 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CENPFP49454 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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