Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GJC1P36383 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GJC1P36383 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GJC1P36383 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms