Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBP2P32456 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GBP2P32456 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms