Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 OR4L1-201ENST00000315683 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC087521.3-202ENST00000526408 743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 GLYCAM1-204ENST00000550226 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 AC116348.1-201ENST00000562525 528 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 AP001065.3-201ENST00000622854 646 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 PCAT1-202ENST00000561978 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 LINC02201-202ENST00000511194 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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ATXN8OSP0DMR3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 REG1B-201ENST00000305089 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 C9orf85-201ENST00000334731 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AL035698.1-201ENST00000405812 564 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 CDC42-IT1-201ENST00000431803 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATXN8OSP0DMR3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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