Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN11O75508 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 343.9 ms