Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CREB3O43889 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms