Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVV-2B6SEH9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms