Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ARID3CA6NKF2 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.6 ms