Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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