Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
USP35Q9P2H5 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms