Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PFDN4Q9NQP4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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