Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRT23Q9C075 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms