Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCE1Q969G3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms