Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RAB6CQ53S08 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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