Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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RFTN1Q14699 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RFTN1Q14699 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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