Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TUBA3CQ13748 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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