Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTP4A2Q12974 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTP4A2Q12974 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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