Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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RAB40BQ12829 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB40BQ12829 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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