Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
E2F1Q01094 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms