Protein–RNA interactions for Protein: P53701

HCCS, Cytochrome c-type heme lyase, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCCSP53701 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HCCSP53701 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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HCCSP53701 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HCCSP53701 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HCCSP53701 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HCCSP53701 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HCCSP53701 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HCCSP53701 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HCCSP53701 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HCCSP53701 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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