Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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GBX2P52951 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GBX2P52951 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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GBX2P52951 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GBX2P52951 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GBX2P52951 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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