Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TUBP50607 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TUBP50607 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TUBP50607 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBP50607 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms