Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LHX1P48742 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LHX1P48742 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LHX1P48742 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms