Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ARL3P36405 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ADAMTS20-201ENST00000389420 6076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 KCNH1-201ENST00000271751 8172 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 AC241952.1-201ENST00000612480 6897 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ARL3P36405 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms