Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCSK1P29120 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms