Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PSMB4P28070 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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