Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ESRRAP11474 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms