Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GCATO75600 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GCATO75600 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GCATO75600 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCATO75600 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCATO75600 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCATO75600 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCATO75600 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GCATO75600 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GCATO75600 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms