Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMG5Q9UPR3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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