Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CIPCQ9C0C6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CIPCQ9C0C6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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