Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SEMA4CQ9C0C4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms