Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC12Q8WUD4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC12Q8WUD4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms