Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FRMPD1Q5SYB0 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms