Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DDR2Q16832 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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