Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PCK2Q16822 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PCK2Q16822 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PCK2Q16822 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PCK2Q16822 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PCK2Q16822 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PCK2Q16822 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PCK2Q16822 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PCK2Q16822 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PCK2Q16822 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PCK2Q16822 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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