Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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PTPRKQ15262 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRKQ15262 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
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