Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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LAPTM4AQ15012 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LAPTM4AQ15012 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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