Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PKP1Q13835 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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