Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNA1SQ13698 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNA1SQ13698 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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