Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CCL7-201ENST00000378569 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AP000793.1-201ENST00000527364 740 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CAMK2BQ13554 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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