Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTP4A2Q12974 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms