Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXC1Q12948 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms